پدینگتون تصمیم می‌گیرد به همراه خانواده براون برای دیدن عمه لوسی که اکنون در خانه خرس‌های بازنشسته اقامت دارد، به کشور پرو سفر کند. اما در این میان وجود یک راز مهم، آن‌ها را به سمت یک ماجراجویی هیجان‌انگیز در جنگل‌های بارانی آمازون و کوه‌های پرو هدایت می‌کند و…