«آقای ربات» در مورد برنامه نویسی جوان به اسم "الیوت" می باشد که با هک کردن مردم با آنها ارتباط برقرار می کند. او از توانایی های خودش به عنوان اسلحه ای برای حفاظت از کسانی که برایش مهم هستند استفاده میکند، اما ناگهان خودش را بین شرکت امنیتی ای که آنجا کار میکند و دنیای زیرزمینیِ هکرها که وی رو وادار میکنند شرکت های آمریکایی را هک کند، قرار میگیرد...
داستان این فیلم دو سال پس از اتفاقات فیلم سرنوشت خشمگین به وقوع میپپوندد. مامور باتجربه لوک هابز تصمیم میگیرد تا با دوست و رقیب قدیمیاش دکارد شاو همکاری کند تا ماموریت یک خلافکار مخوف به نام بریکستون را متوقف کنند. اما…